Но уже в конце августа, когда люди в Москве начали умирать улица за улицей, иконы пришлось вернуть в город — многие верили, что мор прекратится, как только иконы вернутся. Мор не прекратился.
Сам царь, будучи образованным человеком, понимал, что необходимо ограничить распространение эпидемии. Стражникам на платных перевалах было приказано отправлять всех, кто двигался в путь, обратно туда, откуда они приехали, а также ловить и казнить тех, кто пытался объехать перевалы. Карантинные меры также применялись в отношении царской семьи. Таким образом, царской семье, патриарху Никону и самому царю удалось спастись от чумы. В ноябре-декабре эпидемия пошла на спад из-за холодов.